MTの管理画面からアクセスできるスタイルシートのテンプレートは，
@import url(スタイルシートのファイル);
となってて，これはそのまま指定しておくのが吉。
で，実際のスタイルシートは↑で指定したファイルのほうに記述すれば，
そっちのスタイルシートをテキストエディタで自由に編集可能。
逆にそうしないと，スタイルシートの記述を少し変えるたびに再構築が必要に。
htmlを直接書いて何かしたいときとかにも，@importは使えそうです。